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    • 王鹏,白艳玲,肖杨,郑宇宏,孙励,The DIRECT Consortium,王金辉,薛绍伟

      当前状态： 四校优先
      DOI：10.1631/jzus.B2300880
      Abstract：白质纤维在传递感觉和运动信息、促进两侧大脑间的通讯及整合不同脑区方面发挥着至关重要的作用。与此同时，感觉运动功能异常是重度抑郁症（MDD）患者的常见症状之一。然而，MDD中异常的感觉运动白质系统的作用大部分仍是未知的。本研究调查了来自DIRECT联盟的233名MDD患者与257名匹配的健康对照（HC）的白质形态脑网络的拓扑结构变化。白质网络是通过结合基于体素的形态学测量（VBM）和三维离散小波变换（3D-DWT）方法，从磁共振成像（MRI）数据中构建出来，通过使用支持向量机（SVM）分析区分MDD和HC。结果表明，在MDD中，节点度、节点效率和节点介数的网络拓扑异常主要位于感觉运动浅表白质系统中。利用网络节点拓扑特性作为分类特征，SVM模型能有效区分MDD和HC。上述发现从白质形态脑网络的视角出发，强调了感觉运动系统在MDD脑机制中的重要性。  
      Keywords：重度抑郁症;磁共振成像;白质;脑网络   
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      Updated：2024-12-03

    • 陆怡凡,鲍思琦,罗洪科,陈谦明,姒蜜思

      当前状态： 四校优先
      DOI：10.1631/jzus.B2300730
      Abstract：本文通过对随机对照临床试验（RCT）结果进行综述和荟萃（meta）分析，评估全身或局部辅助使用抗生素在种植体周围炎治疗中的疗效。两名研究人员分别独立从三个电子数据库中，筛选符合所有纳入和排除标准的RCT结果的相关文献，并采用meta分析评估种植体留存率（SR）、种植体周袋探诊深度（PPD）、牙槽骨水平（BL）和临床附着水平（CAL）变化的加权平均差异。本文将研究组定义为抗生素组和对照组，并进行亚组分析。最终，7项研究被纳入，包括309例患者（390个种植体）。结果显示，抗生素组的患者在PPD方面表现出显著的改善；亚组分析表明，全身使用抗生素或在非手术治疗中使用抗生素不会显著改变BL。在本综述的研究范围内，无论是通过手术还是非手术方式，辅助使用抗生素都可以改善种植体周围炎治疗中的PPD和SR，在BL和CAL方面也表现出一定程度的效果，但考虑到对照组中缺乏新技术的应用以及目前对抗生素潜在风险的评估受限，医生在临床工作中仍需谨慎选择。  
      Keywords：种植体周围炎;口腔种植体;口腔医学;微生物学;疾病管理;荟萃分析   
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      Updated：2024-12-03

    • Shu Sian HOW,Sylvia CHIENG,Sheila NATHAN,Su Datt LAM

      DOI：10.1631/jzus.B2300641
      Abstract：腺苷三磷酸结合盒转运蛋白（ATP-binding cassette transporter proteins，ABC转运蛋白）具有向外和向内两种转运方式，能通过克服浓度梯度协助多种底物分子在磷脂双分子层中运输。这些转运蛋白具有两个高度保守的核苷酸结合区域（NBDs）和两个跨膜结构域（TMDs）。与ABC向外转运蛋白不同，原核生物的ABC向内转运蛋白还需额外的底物结合蛋白（SBP）作为特定底物转运的识别位点。大量研究发现在细菌致病体中存在许多ABC转运蛋白，提示这些转运蛋白对细菌感染的建立至关重要。现有研究证实，ABC转运蛋白在细菌生长、致病和毒力方面发挥作用，包括导入细胞活动所需的必要营养物质，以及输出与外膜相关的毒力因子和抗微生物物质等。本文对ABC转运蛋白的经典结构和最新分类进行综述，以便全面了解与细菌毒力和致病性相关的ABC转运蛋白在细菌感染期间的活动与作用。  
      Keywords：ABC转运蛋白;细菌致病机制;毒力   
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      Updated：2024-11-21
    • DOI：10.1631/jzus.B23e0019
        
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      Updated：2024-11-21

    • 朱一林,刘繁荣,刘雷,王锦夫,高沨源,叶兰,吴洪磊,周成军,林贵梅,赵小刚,李培超

      当前状态： 四校优先
      DOI：10.1631/jzus.B2300896
      Abstract：六价铬Cr(VI)是一种公认的致癌物，对多种癌症尤其是呼吸道和消化道肿瘤的发生具有促进作用。然而，Cr(VI)在食管癌发生中的潜在作用和相关机制仍未知。本研究选取永生化的人食管上皮细胞（HEECs），通过长期Cr(VI)暴露获得恶性转化细胞系（HEEC-Cr(VI)），以模拟Cr(VI)诱导食管肿瘤发生进程。体外和体内实验表明，与亲代细胞HEECs相比，HEEC-Cr(VI)细胞获得了锚定非依赖性生长的特性、增强的增殖能力、癌症干细胞特性以及在BALB/c裸鼠皮下成瘤的能力。此外，HEEC-Cr(VI)细胞表现出减弱的细胞运动能力以及增强的细胞粘附性。但经过Cr(VI)急性暴露的HEECs细胞未能获得HEEC-Cr(VI)细胞的恶性表型，这表明HEEC-Cr(VI)细胞的恶性表型来源于Cr(VI)诱导的恶性转化，而不是由Cr(VI)直接导致。对其机制的探究结果揭示，长期Cr(VI)暴露诱导的Notch信号通路的异常激活对维持HEEC-Cr(VI)细胞的恶性增殖能力和干性至关重要，而Notch通路的抑制剂DAPT能显著削弱HEEC-Cr(VI)细胞的恶性表型。综上所述，本研究阐明了Cr(VI)诱导食管肿瘤发生的分子机制，为Cr(VI)相关食管癌的基础研究和临床治疗策略提供了新方向。  
      Keywords：六价铬;食管肿瘤发生;恶性增殖;干性;Notch信号通路   
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      Updated：2024-10-18

    • 刘梦琳,樊根豪,孟令凯,杨阔,刘华一

      DOI：10.1631/jzus.B2300343
      Abstract：与普通人群相比，抑郁症患者更易出现慢性胃肠道症状，但这些症状仅被视为抑郁症的躯体症状而缺少特别关注。长期以来，对伴有胃肠道症状的抑郁症患者缺乏适当诊断和有效治疗，因此研究抑郁症与胃肠道疾病间的关联对临床治疗极为重要。越来越多的证据表明，抑郁症与消化道中的微生物群密切相关，而微生物群-肠-脑轴则为抑郁症与胃肠道疾病之间的关联开创了一个新的视角。识别和治疗胃肠道疾病可能预防抑郁症的发作，也可能改善难治性抑郁症的治疗效果。目前抑郁症和微生物相关的肠-脑轴的研究缺乏对胃肠道功能的关注。本综述结合临床前和临床证据，归纳了微生物调控的肠-脑轴在情绪和胃肠道功能中的作用，并总结了潜在治疗策略，为抑郁症伴胃肠道症状的病理机制研究和诊治提供参考。  
      Keywords：抑郁症;胃肠道疾病;肠-脑轴;病理机制;治疗   
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      Updated：2024-09-27

    • 何茹,江弘毅,张铖驰,陈源,刘文顺,邓欣悦,朱骁拯,刘云业,郑传铭,张怡宁,邵程莹,段艳婷,徐加杰

      当前状态： 三校优先
      DOI：10.1631/jzus.B2400192
      Abstract：大量研究表明，CXC基序趋化因子配体16（CXCL16）在癌症中的高表达与预后不良以及肿瘤细胞的增殖、迁移和侵袭有关。虽然CXCL16可以作为肿瘤生物标志物，但其调节头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）的潜在机制尚不清楚。在本研究中，我们旨在研究CXCL16在HNSCC中的表达，并揭示其潜在的生物学机制。我们在癌症基因组图谱（TCGA）数据库、本中心医院HNSCC患者的组织样本和HNSCC细胞系中均检测到CXCL16的高表达。实验结果表明，CXCL16敲低可抑制HNSCC细胞的增殖、迁移和侵袭。转录组测序显示，CXCL16可能通过调节谷胱甘肽过氧化物酶1（GPX1）的抗氧化途径影响HNSCC细胞生长。si-CXCL16细胞中活性氧（ROS）的水平升高，可能与抑制细胞增殖、迁移和侵袭有关。此外，与si-CXCL16组相比，si-CXCL16和GPX1抑制剂Eldecalcitol（ED-71）协同作用组能显著抑制HNSCC细胞的生长。综上，CXCL16可通过调节GPX1介导的抗氧化途径促进HNSCC细胞的发展。因此，靶向细胞CXCL16表达可能是治疗HNSCC的一个候选策略。  
      Keywords：抗氧化途径;CXC基序趋化因子配体16（CXCL16）;谷胱甘肽过氧化物酶1（GPX1）;头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）   
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      Updated：2024-09-27

    • 彭德清,卢睿杰,吕乐瑶,姚情,杨开创,徐云峰,冯小明,潘若浪,麻育源

      当前状态： 三校优先
      DOI：10.1631/jzus.B2300790
      Abstract：多发性硬化症是中枢神经系统的主要脱髓鞘疾病，目前尚无有效治疗方法。本研究探讨了颅骨间充质干细胞（cBMMSC）和Olig2+单克隆来源cBMMSC（sc-cBMMSC）在双环己酮草酰二腙（CPZ）诱导的中枢神经系统脱髓鞘小鼠模型中的作用。通过尾静脉输注cBMMSC和Olig2+ sc-cBMMSC，剂量为1×106个细胞每100微升磷酸盐缓冲液（PBS），每周一次，给药两周。治疗完成一周后，对每组小鼠进行相关指标评估。结果表明，cBMMSC移植可显著提高CPZ诱导的脱髓鞘小鼠在转棒、悬挂和水迷宫试验中的能力；抑制小鼠外周血和中枢神经系统中TNF-α、IL-1β和IL-6等炎症因子的水平；此外，小鼠病理结构也得到改善，具体表现在髓鞘得到显著恢复，以及Olig2和Syn表达增加。值得注意的是，与cBMMSC相比，Olig2+ sc-cBMMSC更为显著地改善了CPZ动物的行为学、髓鞘修复和神经细胞再生。这些发现表明，颅骨髓来源的干细胞在脱髓鞘中具有修复作用，这可能归因于其对少突胶质细胞的免疫调节和保护。Olig2+ sc-cBMMSC移植效果更为显著，进一步证实了间充质干细胞的异质性应被考虑和利用以提高对特定疾病的治疗效果。  
      Keywords：颅骨骨髓;单克隆;间充质干细胞;少突胶质细胞;脱髓鞘   
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      Updated：2024-09-26

    • 赵苗苗,李颖,赵昊阳,蒋超楠,黄满丽

      当前状态： 一校优先
      DOI：10.1631/jzus.B2300765
      Abstract：青少年急性应激障碍（ASD）的症状通常是不典型且偏离常态的，因此未能得到足够重视。及时干预有可能减轻ASD向创伤后应激障碍（PTSD）发展。但对青少年急性应激障碍的诊断和治疗，尚缺乏经验支持和令人信服的证据。本文所述案例围绕两名被诊断为ASD的青少年展开，患者分别经历了反复出现的侵入性痛苦回忆、忍受负面情绪、逃避和睡眠中断。两名青少年在接受重复经颅磁刺激（rTMS）和想象暴露的联合治疗后，精神症状显著改善。此外，在1个月的随访期间，两例患者病情均保持稳定。上述病例表明，rTMS和想象暴露的结合有望成为青少年ASD的治疗策略，值得开展进一步研究。  
      Keywords：接受重复经颅磁刺激（rTMS）;想象暴露;青少年;急性应激障碍（ASD）;病例报告   
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      Updated：2024-09-26

    • 王丽雯,刘惠美,李兰芳

      DOI：10.1631/jzus.B2300853
      Abstract：神经退行性疾病作为中枢神经系统的遗传性疾病，其主要特征是错误折叠的蛋白质聚集体在大脑神经元中缓慢积累。虽然自噬在降解蛋白质聚集体中发挥着至关重要的作用，但目前尚无有效且广泛适用的方法来降解哺乳动物细胞中的蛋白质聚集体。最新研究表明，合成的自噬受体启发的靶向嵌合体（AceTAC）作为降解剂可将选择性自噬受体-p62的LC3相互作用区（LIR）结构域与抗体结合，AceTAC降解剂可选择性靶向分解不同的蛋白质聚集体（例如mHTT、TDP-43和Tau）。此外，这些降解剂可靶向包括线粒体、过氧化物酶体和内质网在内的细胞器。综上，基于自噬的靶向降解剂AceTAC可作为一种有效治疗神经退行性疾病的新方法。  
      Keywords：合成自噬受体;自噬;p62;蛋白质聚集：细胞器   
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      Updated：2024-09-26

    • Giovanni Davide BARONE,周雅琦,汪宏凯,徐孙德,马忠华,Tomislav CERNAVA,陈云

      DOI：10.1631/jzus.B2300914
      Abstract：化学农药防治是当前农业生产中防治作物病虫害最主要的措施，对粮食安全生产起到至关重要的作用。化学农药的不合理使用会导致有害生物抗药性和环境污染等问题，因此利用有益农业微生物资源控制作物有害生物被认为是替代化学防治的可持续举措之一。植物微生物群落对宿主植物的生长发育等具有重要作用，其中部分微生物具有开发为微生物农药和肥料的潜力。全面解析微生物群落中细菌之间的相互作用及其生态功能，对合理利用微生物菌落的功能来维持植物的健康和生产力至关重要。本综述重点关注微生物群落中细菌-细菌之间互作机理及其在不同环境下对作物发育与健康的影响，并强调如何通过调控这种互作改善作物生长环境，以及小分子物质和信号调控通路在细菌-细菌相互作用中的关键作用。本文列举了具有生物活性的细菌代谢产物介导细菌-细菌互作的典型案例及其互作机制。未来需要充分利用人工智能等先进技术，将微生物群落中各种二元互作方式整合到整个微生物组的复杂模型中，以进一步了解微生物群落中各组分间的互作机理，为更好地利用农业有益微生物资源解决作物病虫害等问题提供解决方案。  
      Keywords：植物微生物组;细菌-细菌互作;植物病原物;农作物生产;分子机理   
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      Updated：2024-05-22

    • 黄泰达,郭肖楠,黄小敏,易陈菊,崔一卉,董一言

      DOI：10.1631/jzus.B2300933
      Abstract：压力是抑郁障碍的主要风险因素，通过在特定的脑区和神经环路产生持久的功能异常，进而导致抑郁发作。在压力积累的动态过程中，外侧缰核是大脑众多区域中处理负性情绪信息的关键枢纽，因此被认为参与抑郁症发病。外侧缰核的神经元整合了不同上游脑区输入的负性情绪效价，其中有多个上游脑区选择性支配外侧缰核内侧部或外侧部。与此同时，外侧缰核的亚区通过投射到下游不同的中脑靶区，进行负性情绪效价的分配，并且形成反馈神经环路。尽管已有这些进展，但是在压力诱发抑郁样状态的发病过程中，以外侧缰核为核心的神经环路时空动态机制依然是一个未解之谜。本综述试图提出一个理论框架，描述外侧缰核通过“输入-输出”特异性的神经元架构进行负性情绪效价的整合。值得注意的是，最近的研究揭示了外侧缰核具有一种在生理情况下响应多种压力刺激的“赫伯可塑性”，能够通过特定的上游输入促进神经元的过度兴奋，进而因果性地编码慢性压力的经历和驱动抑郁的发生。综上所述，外侧缰核神经环路的最新进展和未来展望将为抑郁症的早期干预和神经环路特异的抗抑郁疗法带来曙光。  
      Keywords：外侧缰核;神经环路;厌恶;压力动态;抑郁样状态;头对头对比   
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      Updated：2024-04-07

    • 范思雨,陈颖聪,姚伟静,易聪

      当前状态： 一校优先
      DOI：10.1631/jzus.B2300884
      Abstract：作为细胞内重要的物质降解途径，自噬在维持细胞稳态过程中起着至关重要的作用。然而，相较于物质匮乏诱导的自噬，我们对能量匮乏诱导自噬的分子机制和生理病理意义的认识非常有限。因此，我们实验室主要探究细胞如何感知能量匮乏并启动自噬发生。通过酿酒酵母和哺乳动物细胞两种模式生物，我们发现在能量匮乏诱导的自噬发生中，细胞的活性氧（ROS）、DNA损伤感受器Mec1和线粒体有氧呼吸是必需的。本文旨在对这些研究成果进行简要总结，并提出该研究领域今后的重点发展方向。  
      Keywords：自噬;葡萄糖饥饿;固态聚集体自噬;含TCP1伴侣蛋白亚基2（CCT2）   
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      Updated：2024-04-07
    • DOI：10.1631/jzus.ZUSB-D-22-00622-0-lhf-author
      Keywords：巢裸胞壳菌;海洋真菌;芳香聚酮;多硫代二酮哌嗪;细胞毒   
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      Updated：2023-08-17

    • Jun LYU,Qin SU,Jinhui LIU,Lin CHEN,Jiawei SUN,Wenqing ZHANG

      Abstract：目的鉴定褐飞虱中的piggyBac类似元素并评估其转座活性。创新点　首次鉴定了褐飞虱中的piggyBac类似元素并发现NlPLE25具备转座活性。方法使用RepeatMasker和RepeatModeler软件预测褐飞虱基因组中的piggyBac类似元素序列。随后在S2细胞中测试了NlPLE25的切割活性，在Sf9细胞中测试了NlPLE25的转座能力。结论我们从褐飞虱基因组中鉴定出28个piggyBac类似元素。进一步分析NlPLE25发现其在昆虫细胞中引起精确的切除和转座。此外，我们还发现了NlPLE25与piggyBac转座子之间的交叉识别。  
      Keywords：褐飞虱;piggyBac类似元素;转座子;NlPlE25   
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      Updated：2022-05-30

    • Jinbin YE,Haitao XI,Yilu CHEN,Qishu CHEN,Xiaosheng LU,Jineng LV,Yamin CHEN,Feng GU,Junzhao ZHAO

      Abstract：The application of clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR) and CRISPR-associated proteins (Cas) can be limited due to a lack of compatible protospacer adjacent motif (PAM) sequences in the DNA regions of interest. Recently, SpRY, a variant of Streptococcus pyogenes Cas9 (SpCas9), was reported, which nearly completely fulfils the PAM requirement. Meanwhile, PAMs for SpRY have not been well addressed. In our previous study, we developed the PAM Definition by Observable Sequence Excision (PAM-DOSE) and green fluorescent protein (GFP)-reporter system to study PAMs in human cells. Herein, we endeavored to identify the PAMs of SpRY with these two methods. The results indicated that 5'-NRN-3', 5'-NTA-3', and 5'-NCK-3' could be considered as canonical PAMs. 5'-NCA-3' and 5'-NTK-3' may serve as non-priority PAMs. At the same time, PAMs of 5'-NCC-3' and 5'-NTC-3' are not recommended for human cells. These findings provide further insights into the application of SpRY for human genome editing.  
      Keywords：CRISPR/Cas;SpRY;Protospacer adjacent motif (PAM);Recognize   
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      Updated：2022-05-30

    • Jian WANG,Liqian SU,Lun ZHANG,Jiali ZENG,Qingru CHEN,Rui DENG,Ziyan WANG,Weidong KUANG,Xiaobao JIN,Shuiqing GUI,Yinghua XU,Xuemei LU

      Abstract：Ulcerative colitis (UC) is a chronic and recurrent inflammatory bowel disease (IBD) that has become a major gastroenterologic problem during recent decades. Numerous complicating factors are involved in UC development such as oxidative stress, inflammation, and microbiota disorder. These factors exacerbate damage to the intestinal mucosal barrier. Spirulina platensis is a commercial alga with various biological activity that is widely used as a functional ingredient in food and beverage products. However, there have been few studies on the treatment of UC using S. platensis aqueous extracts (SP), and the underlying mechanism of action of SP against UC has not yet been elucidated. Herein, we aimed to investigate the modulatory effect of SP on microbiota disorders in UC mice and clarify the underlying mechanisms by which it alleviates damage to the intestinal mucosal barrier. Dextran sulfate sodium (DSS) was used to establish a normal human colonic epithelial cell (NCM460) injury model and UC animal model. The mitochondrial membrane potential assay 3-‍‍(4,5-dimethylthiazol-2-yl)-2,‍5-diphenyltetrazolium bromide (MTT) and staining with Annexin V-fluorescein isothiocyanate (FITC)/propidium iodide (PI) and Hoechst 33258 were carried out to determine the effects of SP on the NCM460 cell injury model. Moreover, hematoxylin and eosin (H&E) staining, transmission electron microscopy (TEM), enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA), quantitative real-time polymerase chain reaction (qPCR), western blot, and 16S ribosomal DNA (rDNA) sequencing were used to explore the effects and underlying mechanisms of action of SP on UC in C57BL/6 mice. In vitro studies showed that SP alleviated DSS-induced NCM460 cell injury. SP also significantly reduced the excessive generation of intracellular reactive oxygen species (ROS) and prevented mitochondrial membrane potential reduction after DSS challenge. In vivo studies indicated that SP administration could alleviate the severity of DSS-induced colonic mucosal damage compared with the control group. Inhibition of inflammation and oxidative stress was associated with increases in the activity of antioxidant enzymes and the expression of tight junction proteins (TJs) post-SP treatment. SP improved gut microbiota disorder mainly by increasing antioxidant enzyme activity and the expression of TJs in the colon. Our findings demonstrate that the protective effect of SP against UC is based on its inhibition of pro-inflammatory cytokine overproduction, inhibition of DSS-induced ROS production, and enhanced expression of antioxidant enzymes and TJs in the colonic mucosal barrier.  
      Keywords：Spirulina platensis aqueous extracts;Ulcerative colitis;Oxidative stress;Inflammation;Antioxidant;Gut microbiota   
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      Updated：2022-05-30

    • Jinbin YE,Haitao XI,Yilu CHEN,Qishu CHEN,Xiaosheng LU,Jineng LV,Yamin CHEN,Feng GU,Junzhao ZHAO

      DOI：10.1631/jzus.00710
      Abstract：The application of clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR) and CRISPR-associated proteins (Cas) can be limited due to a lack of compatible protospacer adjacent motif (PAM) sequences in the DNA regions of interest. Recently, SpRY, a variant of Streptococcus pyogenes Cas9 (SpCas9), was reported, which nearly completely fulfils the PAM requirement. Meanwhile, PAMs for SpRY have not been well addressed. In our previous study, we developed the PAM Definition by Observable Sequence Excision (PAM-DOSE) and green fluorescent protein (GFP)-reporter system to study PAMs in human cells. Herein, we endeavored to identify the PAMs of SpRY with these two methods. The results indicated that 5'-NRN-3', 5'-NTA-3', and 5'-NCK-3' could be considered as canonical PAMs. 5'-NCA-3' and 5'-NTK-3' may serve as non-priority PAMs. At the same time, PAMs of 5'-NCC-3' and 5'-NTC-3' are not recommended for human cells. These findings provide further insights into the application of SpRY for human genome editing.  
      Keywords：CRISPR/Cas;SpRY;Protospacer adjacent motif (PAM);Recognize   
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      Updated：2022-05-30
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